morph cleanコマンドは、プロジェクト上のコンパイルファイルやキャッシュファイルをクリアするためのコマンドです。
morph clean
内部的なエラーが生じたり、コンパイルがうまくいかない時に一度プロジェクトの隠しファイルなどを綺麗にすることができます。
このオプションを指定すると、プロジェクトルートの隠しファイル(.morph/ディレクトリ内)で、frontendを含めた全てのディレクトリが削除されます。
.morph/
frontend